宏基因組學(xué)和宏轉錄組學(xué)整合分析

　　實(shí)驗介紹宏基因組測序是以特定環(huán)境中的整個(gè)微生物群落作為研究的對象，不需對微生物進(jìn)行分離培養，而是提取環(huán)境微生物總DNA進(jìn)行研究。采用新一代高通量測序技術(shù)對環(huán)境微生物樣品的DNA直接測序。研究微生物群體的物種分類(lèi)、群落結構、系統進(jìn)化、基因功能以及物種間的代謝網(wǎng)絡(luò )等。

 

　　宏轉錄組測序可原位研究特定生境特定時(shí)空下微生物群落中活躍菌種的組成以及活性基因的表達情況。結合理化因素的檢測，宏轉錄組可研究多樣本間由于理化等指標的差異，時(shí)空上不同微生物群落間活躍成分組成的差異分析。結合宏基因組測序，宏轉錄組測序可研究活躍菌種以及高表達基因的組成情況，揭示特定環(huán)境因子影響下菌種的適應性以及基因表達可能的相應機制。

 

　　2. 技術(shù)路線(xiàn)及方法：

　　3. 部分類(lèi)似結果展示

 

　　a. 多個(gè)樣本中的表達結構：

　　Fig1. 5個(gè)樣本的宏轉錄組的表達結構

　　 

　　b. SEED subsytem注釋比較分析

　　Fig2. 宏轉錄組與宏基因組樣本在不同的SEED subsysterm注釋中的物種結構　　 

 

　　3. GH家族的注釋比較分析

　　Fig3. 宏轉錄組與宏基因組樣本在不同的GH注釋中的物種結構

 

　　4. 宏轉錄組顯著(zhù)差異功能分析

　　Fig4. 兩種狀態(tài)下的宏轉錄組樣本的顯著(zhù)差異功能分布火山圖

 

　　5. 關(guān)鍵通路的分析

　　FIG5. 宏轉錄在關(guān)鍵通路中檢測到有差異表達的基因的分布比較

 

　　送樣要求：

 

　　宏轉錄組測序：RNA濃度＞150ng/μl，總量＞2.5μg，濃度以質(zhì)檢結果為準，建議送2次建庫的量，即5μg。260/280在1.8-2.0之間；260/230在1.8-2.0之間。

 

　　宏基因組測序：DNA：?jiǎn)未谓◣焖蜆右螅簼舛龋?00ng/μl，總量＞2.5μg，濃度以質(zhì)檢結果為準，建議送2次建庫的量，即5μg。260/280在1.8-2.0之間；260/230在1.8-2.0之間。