基于轉錄組的進(jìn)化分析

　　實(shí)驗介紹基于轉錄組數據進(jìn)行進(jìn)化分析核心原理就是構建直系同源基因簇，獲得進(jìn)化分析的super matrix。

 

　　方法目前來(lái)說(shuō)有兩種，基于super matrix和super tree。

 

　　基于super matrix的方法也就是在基于barcode的進(jìn)化分析流程中給出的方法，也是基于數目不多的多個(gè)基因構建進(jìn)化樹(shù)的常用方法，對不同的直系同源基因簇分別在物種間比對后序列串聯(lián)起來(lái)，在根據這個(gè)super matrix（這里的matrix指序列）構建進(jìn)化樹(shù)。

 

　　而基于super tree的方法構建進(jìn)化樹(shù)則與前面流程圖所示相似，先對不同直系同源基因簇分別多序列比對，然后分別構建進(jìn)化樹(shù)，再將不同基因簇構建的進(jìn)化樹(shù)整合在一起形成物種樹(shù)。不論是super matrix 或者super tree構建的進(jìn)化樹(shù)，都充分利用了基因組上的遺傳信息，相比于單個(gè)或少數幾個(gè)基因構建進(jìn)化樹(shù)來(lái)講，更符合構建進(jìn)化樹(shù)的模型，堿基的使用偏倚、密碼子使用偏好、位點(diǎn)間差異率等更傾向于真實(shí)的進(jìn)化模型。在計算條件允許的情況下，利用最多的同源基因簇基因構建的進(jìn)化樹(shù)更符合真實(shí)的進(jìn)化歷程。

 

　　可研生物科技有限公司為客戶(hù)提供快速的轉錄組的進(jìn)化分析，并提供后續個(gè)性化分析，一對一溝通項目問(wèn)題。

 

　　服務(wù)流程：