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GO富集分析

發(fā)布時(shí)間:2021/09/24
GO富集分析

  實(shí)驗介紹GO功能注釋的目的在于將所要研究的基因集合與基因功能關(guān)聯(lián)。The Gene Ontology是一個(gè)在線(xiàn)數據庫,它的主要功能在于將基因產(chǎn)物的功能以標準化的詞匯描述出來(lái),分為生物學(xué)過(guò)程(BP),細胞組分(CC),分子功能(MF)三個(gè)分支。利用相關(guān)工具,可以將基因集合注釋到這三個(gè)分支的具體條目(term)上,從而了解基因集合的功能。

 

  分析內容:

 

  對提供的基因列表(例如差異表達基因)進(jìn)行Gene Ontology功能分析,得到顯著(zhù)的富集結果(P<0.05或者P<0.01).提供所有富集結果以及對重要結論進(jìn)行作圖。

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  圖1. 差異表達基因(上調和下調)的GO富集分析結果圖


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