蛋白質(zhì)組芯片

實(shí)驗介紹蛋白質(zhì)組芯片是一種高通量的蛋白功能分析技術(shù),可用于蛋白質(zhì)表達譜分析,研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用,甚至DNA-蛋白質(zhì)、RNA-蛋白質(zhì)的相互作用,篩選藥物作用的蛋白靶點(diǎn)等。
應用蛋白質(zhì)組芯片可以進(jìn)行基因表達的篩選、抗原抗體檢測、蛋白篩選、生化反應檢測、藥物篩選以及疾病診斷等,相比于質(zhì)譜的昂貴報價(jià)以及數據量來(lái)說(shuō),蛋白質(zhì)組芯片的優(yōu)勢更加明顯。
可研生物科技有限公司推出自主知識產(chǎn)權的蛋白質(zhì)芯片標準分析流程,可以快讀準確的讀取蛋白質(zhì)組芯片并進(jìn)行標準分析,精準的獲得芯片檢測結果,同時(shí)提供個(gè)性化下游分析策略。
服務(wù)流程:
常規分析流程:
1. 芯片預處理,樣本peak雙向聚類(lèi)
2. 過(guò)濾分析,PCA分析,發(fā)現離群樣本,PCA分析是一種降維技術(shù),可以將多維(即蛋白peak數)的芯片數據投射到低維空間中。相似的樣本所在的點(diǎn)將彼此靠近,可以通過(guò)PCA分析找到那些“離群”的樣本。
3. 分組差異peak的篩選,根據實(shí)驗樣本的分組情況進(jìn)行差異峰的篩選,并進(jìn)行聚類(lèi)分析,確定差異峰(蛋白)及不同樣本之間的互作關(guān)系。一般認為在聚類(lèi)圖上距離越近的樣本或差異峰之間的關(guān)系越密切。
4. 疾病預測模型的構建,利用決策樹(shù),神經(jīng)網(wǎng)絡(luò ),SVM等機器學(xué)習方法來(lái)建立了分組診斷的模型,目的在于利用實(shí)驗數據來(lái)篩選出一批靶標peak,并以此構建模型,以進(jìn)行早期診斷、疾病預測和預后分析。
5. peak注釋。功能分析,從基因水平上研究差異peak的功能信息,從不能的處理實(shí)驗對比發(fā)現疾病的分子機制。