蛋白質(zhì)組全譜數據分析

　　實(shí)驗介紹蛋白質(zhì)組的定義

 

　　蛋白質(zhì)組(Proteome)指由一個(gè)基因組或一個(gè)細胞、組織表達的所有蛋白質(zhì)。在轉錄時(shí)，一個(gè)基因可以多種mRNA形式剪接，一個(gè)蛋白質(zhì)組不是一個(gè)基因組的直接產(chǎn)物，蛋白質(zhì)組中蛋白質(zhì)的數目有時(shí)可以超過(guò)基因組的數目。

 

　　蛋白質(zhì)組全譜分析的意義

 

　　蛋白質(zhì)全譜分析目的在于識別出生物組織、血液或提取物中盡可能多的肽和蛋白質(zhì)混合物的組分，基于高精度液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)的蛋白自全譜分析，可以對蛋白質(zhì)混合物進(jìn)行組分分析，并進(jìn)行相應的生物信息分析包括蛋白質(zhì)的鑒定、GO分類(lèi)和代謝通路的分析等，為蛋白質(zhì)組學(xué)提供有力工具。

 

　　全譜分析適用范圍：

 

　　蛋白質(zhì)全譜分析適用于肽和蛋白質(zhì)的鑒定及特殊生理狀態(tài)下的整體規律研究。

 

　　服務(wù)流程:

 

　　蛋白質(zhì)全譜分析內容：

 

　　1.質(zhì)譜原始數據格式轉換，得到質(zhì)譜峰圖

 

　　圖1. 蛋白質(zhì)原始質(zhì)譜數據解譜

 

　　2.原始數據質(zhì)量篩選，確定多肽片段序列，數據統計

 

　　圖2. 根據打分值確定多肽序列片段

 

　　 

 

　　3.查詢(xún)nr/swissprot等數據庫，鑒定蛋白，數據統計

 

　　圖3. 數據統計：（左）每個(gè)質(zhì)譜圖對應的peak數目分布（右）鑒定到的每個(gè)蛋白對應的多肽片段數分布

 

　　4.查找特定生理狀態(tài)下的特有蛋白質(zhì)，進(jìn)行后續個(gè)性化分析

 

　　圖4. 對感興趣的蛋白質(zhì)利用STRING構建蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò )

 

　　圖5. 篩選到的關(guān)鍵蛋白三維結構展示(圖像來(lái)自PDB數據，從左到右依次為：蛋白質(zhì)三維結構，通路中蛋白蛋白相互作用，蛋白質(zhì)與抑制劑的相互作用）

 

　　圖6. 可能的關(guān)鍵蛋白的抑制劑

 

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