轉錄調控網(wǎng)絡(luò )分析

　　實(shí)驗介紹轉錄因子（Transcription factors ，TFs）可以結合在基因上游特異的核苷酸序列上，以此調控基因的表達?；蜣D錄調控網(wǎng)絡(luò )描述轉錄因子及其調控的基因之間的關(guān)系。理論上，基因調控網(wǎng)絡(luò )包含所有可能發(fā)生的基因調控關(guān)系和實(shí)現某種生物學(xué)功能的不同調控關(guān)系的組合機制。通過(guò)手工注釋和高通量實(shí)驗獲得的基因調控關(guān)系使大范圍地分析基因調控網(wǎng)絡(luò )成為可能。但是，哺乳動(dòng)物的基因調控信息還是遠遠不夠的?；蛘{控網(wǎng)絡(luò )也可以用有向圖表示，其中點(diǎn)表示轉錄因子或者被調控的基因，邊表示轉錄因子對基因的調控關(guān)系，箭頭指向被調控的基因。

 

　　分析內容：提供感興趣的靶基因列表（一個(gè)或者多個(gè)），分析調控靶基因的轉錄因子；或者提供感興趣的轉錄因子，分析其調控的靶基因信息。并根據關(guān)系對做調控網(wǎng)絡(luò )圖。

 

　　圖1.  轉錄調控網(wǎng)絡(luò )圖。菱形代表轉錄因子，圓形代表靶基因;邊代表調控關(guān)系。