基因富集結果模塊聚類(lèi)和篩選關(guān)鍵基因

　　實(shí)驗介紹對基因集進(jìn)行富集分析時(shí)，常會(huì )得到很多富集條目，過(guò)多的富集結果不容易展示和解釋?；贔GNet包，我們開(kāi)發(fā)此模塊，旨在將基因注釋到相似功能條目上（如GO，kegg），對功能條目進(jìn)行聚類(lèi)劃分，分析聚類(lèi)之間的相似性，以及關(guān)鍵基因。便于從多個(gè)富集結果中分析出重要基因。

 

　　2.流程圖

 

　　3結果展示

 

　　圖1  FGNet分析功能網(wǎng)絡(luò )圖。左圖表示將基因注釋到不同功能模塊中，白色節點(diǎn)是連接功能模塊之間的重要預測節點(diǎn)，Mg表示模塊，每個(gè)模塊包括GO term和KEGG pathway；右圖展示了通過(guò)多功能基因連接模塊的總體分布圖。

 

　　圖2 功能模塊之間的層次聚類(lèi)結果，color bar表示distance，由該圖可以看出不同模塊之間的距離，距離越大，表示相似性越小