甲基化檢測(MSP/BSP/qMSP/HRM)

實(shí)驗介紹DNA甲基化在人的正常發(fā)育、X染色體失活、衰老以及許多人類(lèi)疾?。ㄈ绨l(fā)育畸形、癌癥、心血管疾病、糖尿病和神經(jīng)心理失調等)過(guò)程中發(fā)揮重要作用,已經(jīng)成為表觀(guān)遺傳學(xué)和表觀(guān)基因組學(xué)的重要研究?jì)热荨?DNA甲基化是表觀(guān)遺傳修飾的主要方式,它是由DNA甲基轉移酶(DNA methyl-transferase,Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作為甲基供體,將胞嘧啶轉變?yōu)?-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應,它并不改變DNA的一級結構,卻在細胞的發(fā)育、基因的表達、及基因組的穩定性中起著(zhù)重要的作用。CpG島的高甲基化是腫瘤中存在的普遍現象,而啟動(dòng)子CpG島的高甲基化是除突變和缺失外腫瘤中抑癌基因失活的第三種機制。 因此,基因啟動(dòng)子甲基化檢測在臨床診斷(如甲基化檢測與低劑量CT相結合)、藥物敏感性檢測等方面具有很高的應用價(jià)值。
服務(wù)項目依據實(shí)驗目的及用途的不同,本公司可做以下幾種服務(wù):
1> MSP:甲基化定性分析
2> qMSP:對于驗證的CpG Island,進(jìn)行穩定的高度定量和靈敏的甲基化檢測分析
3> BSP:甲基化克隆測序分析,一般挑選10-15個(gè)克隆進(jìn)行測序分析,一般可以提供≥10個(gè)測序結果
4> HRM:高分辨率溶解曲線(xiàn)進(jìn)行甲基化分析
交付結果:實(shí)驗報告、返還樣本及產(chǎn)物
質(zhì)量保證:客觀(guān)、公正、可信數據結果
交付時(shí)間:大約10-15個(gè)工作日(根據預實(shí)驗、樣本數量情況決定)
服務(wù)流程1、 依據客戶(hù)提供的基因及下游實(shí)驗,設計合成相應引物
2、 DNA提取與質(zhì)量分析
3、 亞硫酸鹽修飾即CT轉換
4、 預實(shí)驗驗證引物,優(yōu)化PCR條件
5、 MSP:普通PCR產(chǎn)物電泳
qMSP:選擇合適的內參及優(yōu)化后的引物,進(jìn)行熒光定量PCR
BSP:對普通PCR獲得的產(chǎn)物進(jìn)行純化,TA克隆,挑選10-15個(gè)克隆進(jìn)行測序,提供≥10個(gè)測序成功結果
HRM:選擇優(yōu)化后的引物,進(jìn)行熒光定量PCR
6、對實(shí)驗結果進(jìn)行分析,撰寫(xiě)詳細實(shí)驗報告,包括引物序列,包括DNA提取方法、DNA電泳圖、普通PCR電泳圖、qPCR擴增曲線(xiàn)、溶解曲線(xiàn)、院士程序、菌液PCR電泳圖、測序原始文件及測序結果分析,以及最終的甲基化程序分析。
樣本要求可用于提取基因組的實(shí)驗材料,如細胞(≥105個(gè))、組織(≥50mg)
實(shí)驗周期:10-15個(gè)工作日(根據預實(shí)驗、樣本數量、基因情況決定)
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