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小RNA測序數據

發(fā)布時(shí)間:2021/09/24
小RNA測序數據

  實(shí)驗介紹Small RNA是一類(lèi)重要的體內調節分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA??蓞⑴c基因轉錄后調控,調節細胞生長(cháng)、分化,以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程。Small RNA測序是研究生物樣品小RNA的最主要方法之一,首先采用膠分離技術(shù),收集樣品中18-30nt的RNA片段;再利用高通量測序技術(shù),一次性獲得單堿基分辨率的數百萬(wàn)條小RNA序列信息。

 

  應用

 

  1. 觀(guān)察疾病發(fā)生過(guò)程中病灶部位內部miRNA的表達異常,確定與疾病相關(guān)miRNA

 

  2. 基于小RNA樣本的新miRNA預測和新miRNA的調控靶基因預測

 

  服務(wù)流程:

 

  數據處理和分析流程圖

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  示例1 A圖為測序序列分類(lèi),B圖為每個(gè)類(lèi)別中序列長(cháng)度分布,C圖為miRNA表達水平聚類(lèi)

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  示例2 miRNA、靶基因與miRNA上游TF網(wǎng)絡(luò )圖

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  示例3 miRNA預測結果示意圖


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