DNA甲基化之MeDIP-Seq

　　實(shí)驗介紹MeDIP-Seq 全稱(chēng)Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，即甲基化DNA免疫共沉淀測序。該種測序方法通過(guò)使用5'-甲基胞嘧啶抗體特異性抓去樣本中甲基化程度高的DNA片段，并對富集的DNA片段進(jìn)行高通量測序。相對于BS-seq和RRBS-seq技術(shù)而言，MeDIP-seq技術(shù)以較小的數據量和較高的性?xún)r(jià)比，幫助科研人員檢測基因組上的甲基化區域。

 

　　需要注意的是，MeDIP-seq生成DNA甲基化圖譜最小分辨率在50-100bp左右，無(wú)法達到BS-seq和RRBS-seq的單堿基分辨率。

 

　　應用

 

　　1、處于特定時(shí)期或特定處理條件下的樣本中，研究樣本中染色體DNA甲基化模式；

 

　　2、比較不同細胞、組織、樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異。

 

　　3、疾病樣本中，與疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān)的DNA甲基化表觀(guān)遺傳機理研究和相關(guān)DNA甲基化分子標志物的探索性研究。

 

　　我們能提供詳盡的全基因組重測序數據的處理和分析服務(wù)。

 

　　如您沒(méi)有標準化的數據、只需流程中的局部分析內容或要求特立獨行的數據分析思路，我們亦能滿(mǎn)足您的要求。

 

　　服務(wù)流程:數據處理和分析流程圖

　　示例圖片展示

　　示例圖1. DNA甲基化信號在不同類(lèi)型染色體區域的分布

　　示例圖2. 特定基因區域內甲基化信號展示[1]

 

　　示例圖3. 基因TSS位點(diǎn)周?chē)谆盘柗植继卣鞣诸?lèi)[1]

 

　　參考文獻[1].Kim, J.H., et al., Deep sequencing reveals distinct patterns of DNA methylation in prostate cancer. Genome Res, 2011. 21(7): p. 1028-41.