DNA甲基化之WGBS和RRBS

　　實(shí)驗介紹WGBS全稱(chēng)Whole Genome Bisulfite Seuqneicng，即全基因組重亞硫酸鹽測序。該方法通過(guò)Bisulfite處理，將原基因組中未發(fā)生甲基化的C堿基轉換成U的同時(shí)，保留所有甲基化C的堿基不發(fā)生轉變，從而幫助科研人員識別發(fā)生甲基化的CpG位點(diǎn)。該種測序技術(shù)適用于繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。

 

　　RRBS全稱(chēng)Reduced Representation Bisulfite Sequencing，即簡(jiǎn)化代表性重亞硫酸鹽測序。該方法在Bisulfite處理前，使用MspI（該酶的酶切位點(diǎn)為CCGG）酶切對樣本進(jìn)行處理，去除低CG含量DNA片段，從而使用較小的數據量富集到盡可能多的包含CpG位點(diǎn)的DNA片段。

 

　　相比于WGBS技術(shù)，RRBS是一種準確、高效且經(jīng)濟的DNA甲基化研究方法，通過(guò)酶切，并進(jìn)行Bisulfite測序，該方法在保證DNA甲基化狀態(tài)檢測的高分辨率的同時(shí)提升測序數據的高利用率。

 

　　醫用

 

　　1. 處于特定時(shí)期或特定處理條件下的樣本中，研究樣本中染色體高精度DNA甲基化模式；

 

　　2. 比較不同細胞、組織、樣本間的高精度DNA甲基化修飾模式的差異；

 

　　3. 疾病樣本中，與疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān)的高精度DNA甲基化表觀(guān)遺傳機理研究和相關(guān)高精度DNA甲基化位點(diǎn)分子標志的探索性研究。

 

　　我們能提供詳盡的全基因組重測序數據的處理和分析服務(wù)。

 

　　如您沒(méi)有標準化的數據、只需流程中的局部分析內容或要求特立獨行的數據分析思路，我們亦能滿(mǎn)足您的要求。

 

　　服務(wù)流程:數據處理和分析流程圖

 

　　分析結果示例圖片展示

 

　　示例圖1. 樣本中各區域DNA甲基化水平信息統計和樣本間差異DNA甲基化分析結果展示[1]

 

　　示例圖2. 差異DNA甲基化區域內轉錄因子基序識別[1]

 

　　示例圖3. DNA甲基化水平變化與基因表達水平變化的關(guān)聯(lián)性分析[1]

 

　　參考文獻[1].Ng, C.W., et al., Extensive changes in DNA methylation are associated with expression of mutant huntingtin. Proc Natl Acad Sci U S A, 2013. 110(6): p. 2354-9.