微生物基因組Denovo測序分析

　　實(shí)驗介紹微生物基因組De novo測序分析也叫微生物基因組從頭測序分析，指不依賴(lài)于任何參考序列信息就可對某個(gè)微生物進(jìn)行分析的測序分析技術(shù)，用生物信息學(xué)的方法進(jìn)行序列拼接獲得該物種的基因組序列圖譜，然后進(jìn)行注釋等后續一系列的分析。微生物Denovo基因組測序及分析技術(shù)可以應用于醫藥衛生等領(lǐng)域。

 

　　技術(shù)應用領(lǐng)域

 

　　基因組圖譜的系統性構建

 

　　微生物致病性和耐藥性位點(diǎn)檢測及相關(guān)基因功能研究

 

　　微生物的比較基因組分析，確定各個(gè)近緣微生物中的系統發(fā)育關(guān)系

 

　　服務(wù)流程:基本分析流程圖

 

　　可能的結果展示圖

 

　　示例圖1 微生物基因組的功能注釋[1]

 

　　示例圖2 微生物基因組的系統進(jìn)化關(guān)系[1]

 

　　參考文獻示例圖參考文獻[1] Van den Bogert B1, Boekhorst J2, Herrmann R1, Smid EJ3, Zoetendal EG1, Kleerebezem M4. Comparative genomics analysis of Streptococcus isolates from the human small intestine reveals their adaptation to a highly dynamic ecosystem. PLoS One. 2013 Dec 30;8(12):e83418.